Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms