Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap4s1Q9WVL1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms