Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2Q9UMS6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms