Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF1DQ9H5J8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms