Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc46a3Q9DC26 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc46a3Q9DC26 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms