Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Prdm5Q9CXE0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Prdm5Q9CXE0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Prdm5Q9CXE0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Prdm5Q9CXE0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Prdm5Q9CXE0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Prdm5Q9CXE0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Prdm5Q9CXE0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Prdm5Q9CXE0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Prdm5Q9CXE0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Prdm5Q9CXE0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Prdm5Q9CXE0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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