Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Psmd8Q9CX56 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmd8Q9CX56 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms