Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tsnaxip1Q99P25 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms