Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN7

Igsf5, Immunoglobulin superfamily member 5, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf5Q7TSN7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Igsf5Q7TSN7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igsf5Q7TSN7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms