Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSSK4Q6SA08 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSSK4Q6SA08 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms