Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms