Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms