Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRMS1LQ5PSV4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRMS1LQ5PSV4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms