Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDCA8Q53HL2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA8Q53HL2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148 ms