Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TraddQ3U0V2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms