Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc102aQ3TMW1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms