Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cbx1P83917 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx1P83917 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms