Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vamp3P63024 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp3P63024 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms