Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTRNP46939 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTRNP46939 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTRNP46939 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTRNP46939 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTRNP46939 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UTRNP46939 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTRNP46939 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTRNP46939 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTRNP46939 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTRNP46939 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTRNP46939 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTRNP46939 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTRNP46939 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTRNP46939 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UTRNP46939 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTRNP46939 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTRNP46939 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTRNP46939 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTRNP46939 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTRNP46939 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UTRNP46939 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTRNP46939 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTRNP46939 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UTRNP46939 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTRNP46939 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UTRNP46939 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTRNP46939 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTRNP46939 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTRNP46939 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTRNP46939 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTRNP46939 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTRNP46939 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UTRNP46939 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTRNP46939 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTRNP46939 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UTRNP46939 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UTRNP46939 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UTRNP46939 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UTRNP46939 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UTRNP46939 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms