Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BgnP28653 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BgnP28653 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BgnP28653 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BgnP28653 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms