Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIN3BO60391 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIN3BO60391 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN3BO60391 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN3BO60391 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIN3BO60391 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms