Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sp100O35892 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sp100O35892 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sp100O35892 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sp100O35892 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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