Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps1O08983 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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