Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm17577J3QNF7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17577J3QNF7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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