Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gcom1E9PZ54 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gcom1E9PZ54 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms