Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd2Q9Z2E1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd2Q9Z2E1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd2Q9Z2E1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd2Q9Z2E1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd2Q9Z2E1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd2Q9Z2E1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd2Q9Z2E1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd2Q9Z2E1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd2Q9Z2E1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd2Q9Z2E1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd2Q9Z2E1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd2Q9Z2E1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd2Q9Z2E1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd2Q9Z2E1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Mbd2Q9Z2E1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms