Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd4Q9Z2D7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd4Q9Z2D7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd4Q9Z2D7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd4Q9Z2D7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd4Q9Z2D7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mbd4Q9Z2D7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mbd4Q9Z2D7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd4Q9Z2D7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd4Q9Z2D7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd4Q9Z2D7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd4Q9Z2D7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd4Q9Z2D7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd4Q9Z2D7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd4Q9Z2D7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd4Q9Z2D7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd4Q9Z2D7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd4Q9Z2D7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd4Q9Z2D7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd4Q9Z2D7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd4Q9Z2D7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd4Q9Z2D7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd4Q9Z2D7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd4Q9Z2D7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd4Q9Z2D7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd4Q9Z2D7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd4Q9Z2D7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd4Q9Z2D7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd4Q9Z2D7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd4Q9Z2D7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd4Q9Z2D7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd4Q9Z2D7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms