Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tulp1Q9Z273 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tulp1Q9Z273 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tulp1Q9Z273 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tulp1Q9Z273 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tulp1Q9Z273 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tulp1Q9Z273 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp1Q9Z273 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tulp1Q9Z273 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp1Q9Z273 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp1Q9Z273 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tulp1Q9Z273 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tulp1Q9Z273 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tulp1Q9Z273 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tulp1Q9Z273 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tulp1Q9Z273 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tulp1Q9Z273 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tulp1Q9Z273 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tulp1Q9Z273 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tulp1Q9Z273 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tulp1Q9Z273 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tulp1Q9Z273 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tulp1Q9Z273 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tulp1Q9Z273 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tulp1Q9Z273 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tulp1Q9Z273 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tulp1Q9Z273 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tulp1Q9Z273 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tulp1Q9Z273 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms