Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Trip6Q9Z1Y4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Trip6Q9Z1Y4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Trip6Q9Z1Y4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
Trip6Q9Z1Y4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Trip6Q9Z1Y4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Trip6Q9Z1Y4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Trip6Q9Z1Y4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Trip6Q9Z1Y4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Trip6Q9Z1Y4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Trip6Q9Z1Y4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Trip6Q9Z1Y4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Trip6Q9Z1Y4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Trip6Q9Z1Y4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Trip6Q9Z1Y4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29,87■■■□□ 2,37
Trip6Q9Z1Y4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Trip6Q9Z1Y4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Trip6Q9Z1Y4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Trip6Q9Z1Y4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Trip6Q9Z1Y4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Trip6Q9Z1Y4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Trip6Q9Z1Y4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Trip6Q9Z1Y4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Trip6Q9Z1Y4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Trip6Q9Z1Y4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Trip6Q9Z1Y4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Trip6Q9Z1Y4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Trip6Q9Z1Y4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Trip6Q9Z1Y4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Trip6Q9Z1Y4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Trip6Q9Z1Y4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Trip6Q9Z1Y4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Trip6Q9Z1Y4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Trip6Q9Z1Y4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Trip6Q9Z1Y4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Trip6Q9Z1Y4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Trip6Q9Z1Y4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Trip6Q9Z1Y4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Trip6Q9Z1Y4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Trip6Q9Z1Y4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Trip6Q9Z1Y4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Trip6Q9Z1Y4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Trip6Q9Z1Y4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Trip6Q9Z1Y4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Trip6Q9Z1Y4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Trip6Q9Z1Y4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Trip6Q9Z1Y4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Trip6Q9Z1Y4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Trip6Q9Z1Y4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Trip6Q9Z1Y4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Trip6Q9Z1Y4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Trip6Q9Z1Y4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Trip6Q9Z1Y4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Trip6Q9Z1Y4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Trip6Q9Z1Y4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Trip6Q9Z1Y4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Trip6Q9Z1Y4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Trip6Q9Z1Y4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Trip6Q9Z1Y4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Trip6Q9Z1Y4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Trip6Q9Z1Y4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Trip6Q9Z1Y4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Trip6Q9Z1Y4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Trip6Q9Z1Y4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Trip6Q9Z1Y4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Trip6Q9Z1Y4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Trip6Q9Z1Y4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,32
Trip6Q9Z1Y4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,7 ms