Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog1Q9Z160 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cog1Q9Z160 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog1Q9Z160 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog1Q9Z160 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cog1Q9Z160 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cog1Q9Z160 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cog1Q9Z160 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cog1Q9Z160 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cog1Q9Z160 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cog1Q9Z160 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cog1Q9Z160 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cog1Q9Z160 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cog1Q9Z160 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cog1Q9Z160 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cog1Q9Z160 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cog1Q9Z160 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cog1Q9Z160 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cog1Q9Z160 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms