Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Pmfbp1Q9WVQ0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Pmfbp1Q9WVQ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Pmfbp1Q9WVQ0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Pmfbp1Q9WVQ0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Pmfbp1Q9WVQ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Pmfbp1Q9WVQ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Pmfbp1Q9WVQ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Pmfbp1Q9WVQ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Pmfbp1Q9WVQ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Pmfbp1Q9WVQ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Pmfbp1Q9WVQ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28,2■■■□□ 2,1
Pmfbp1Q9WVQ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Pmfbp1Q9WVQ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Pmfbp1Q9WVQ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Pmfbp1Q9WVQ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Pmfbp1Q9WVQ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Pmfbp1Q9WVQ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Pmfbp1Q9WVQ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Pmfbp1Q9WVQ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Pmfbp1Q9WVQ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Pmfbp1Q9WVQ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,08
Pmfbp1Q9WVQ0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Pmfbp1Q9WVQ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Pmfbp1Q9WVQ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Pmfbp1Q9WVQ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Pmfbp1Q9WVQ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Pmfbp1Q9WVQ0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Pmfbp1Q9WVQ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Pmfbp1Q9WVQ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Pmfbp1Q9WVQ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Pmfbp1Q9WVQ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms