Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pfdn5Q9WU28 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pfdn5Q9WU28 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pfdn5Q9WU28 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pfdn5Q9WU28 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms