Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NbnQ9R207 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NbnQ9R207 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NbnQ9R207 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NbnQ9R207 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NbnQ9R207 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NbnQ9R207 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NbnQ9R207 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NbnQ9R207 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NbnQ9R207 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NbnQ9R207 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NbnQ9R207 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NbnQ9R207 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NbnQ9R207 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NbnQ9R207 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NbnQ9R207 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NbnQ9R207 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NbnQ9R207 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NbnQ9R207 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NbnQ9R207 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NbnQ9R207 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NbnQ9R207 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NbnQ9R207 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NbnQ9R207 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NbnQ9R207 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NbnQ9R207 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NbnQ9R207 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NbnQ9R207 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NbnQ9R207 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NbnQ9R207 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NbnQ9R207 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NbnQ9R207 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NbnQ9R207 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NbnQ9R207 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NbnQ9R207 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NbnQ9R207 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NbnQ9R207 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NbnQ9R207 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NbnQ9R207 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NbnQ9R207 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NbnQ9R207 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NbnQ9R207 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NbnQ9R207 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NbnQ9R207 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NbnQ9R207 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NbnQ9R207 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NbnQ9R207 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NbnQ9R207 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NbnQ9R207 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NbnQ9R207 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NbnQ9R207 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NbnQ9R207 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms