Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Lhx6Q9R1R0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhx6Q9R1R0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhx6Q9R1R0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lhx6Q9R1R0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lhx6Q9R1R0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms