Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcm1Q9R0L6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcm1Q9R0L6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcm1Q9R0L6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcm1Q9R0L6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcm1Q9R0L6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcm1Q9R0L6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcm1Q9R0L6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcm1Q9R0L6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcm1Q9R0L6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcm1Q9R0L6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcm1Q9R0L6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcm1Q9R0L6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms