Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Zeb2Q9R0G7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Zeb2Q9R0G7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Zeb2Q9R0G7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Zeb2Q9R0G7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Zeb2Q9R0G7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Zeb2Q9R0G7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Zeb2Q9R0G7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Zeb2Q9R0G7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Zeb2Q9R0G7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC31,46■■■□□ 2,63
Zeb2Q9R0G7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Zeb2Q9R0G7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Zeb2Q9R0G7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Zeb2Q9R0G7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Zeb2Q9R0G7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Zeb2Q9R0G7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Zeb2Q9R0G7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Zeb2Q9R0G7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Zeb2Q9R0G7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Zeb2Q9R0G7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Zeb2Q9R0G7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Zeb2Q9R0G7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC31,41■■■□□ 2,62
Zeb2Q9R0G7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Zeb2Q9R0G7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
Zeb2Q9R0G7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Zeb2Q9R0G7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Zeb2Q9R0G7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Zeb2Q9R0G7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Zeb2Q9R0G7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Zeb2Q9R0G7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Zeb2Q9R0G7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Zeb2Q9R0G7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Zeb2Q9R0G7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Zeb2Q9R0G7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Zeb2Q9R0G7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Zeb2Q9R0G7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Zeb2Q9R0G7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Zeb2Q9R0G7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC31,33■■■□□ 2,61
Zeb2Q9R0G7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC31,33■■■□□ 2,61
Zeb2Q9R0G7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Zeb2Q9R0G7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31,32■■■□□ 2,6
Zeb2Q9R0G7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Zeb2Q9R0G7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Zeb2Q9R0G7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC31,3■■■□□ 2,6
Zeb2Q9R0G7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Zeb2Q9R0G7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
Zeb2Q9R0G7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Zeb2Q9R0G7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Zeb2Q9R0G7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Zeb2Q9R0G7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Zeb2Q9R0G7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Zeb2Q9R0G7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC31,26■■■□□ 2,59
Zeb2Q9R0G7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Zeb2Q9R0G7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Zeb2Q9R0G7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Zeb2Q9R0G7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Zeb2Q9R0G7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Zeb2Q9R0G7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Zeb2Q9R0G7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31,24■■■□□ 2,59
Zeb2Q9R0G7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Zeb2Q9R0G7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Zeb2Q9R0G7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Zeb2Q9R0G7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Zeb2Q9R0G7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Zeb2Q9R0G7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC31,2■■■□□ 2,59
Zeb2Q9R0G7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Zeb2Q9R0G7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,58
Zeb2Q9R0G7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31,19■■■□□ 2,58
Zeb2Q9R0G7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Zeb2Q9R0G7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC31,19■■■□□ 2,58
Zeb2Q9R0G7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Zeb2Q9R0G7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Zeb2Q9R0G7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Zeb2Q9R0G7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC31,17■■■□□ 2,58
Zeb2Q9R0G7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31,17■■■□□ 2,58
Zeb2Q9R0G7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31,17■■■□□ 2,58
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Zeb2Q9R0G7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,15■■■□□ 2,58
Zeb2Q9R0G7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
Zeb2Q9R0G7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Zeb2Q9R0G7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Zeb2Q9R0G7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Zeb2Q9R0G7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Zeb2Q9R0G7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Zeb2Q9R0G7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Zeb2Q9R0G7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Zeb2Q9R0G7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Zeb2Q9R0G7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31,09■■■□□ 2,57
Zeb2Q9R0G7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Zeb2Q9R0G7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Zeb2Q9R0G7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,57
Zeb2Q9R0G7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Zeb2Q9R0G7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC31,07■■■□□ 2,56
Zeb2Q9R0G7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Zeb2Q9R0G7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Zeb2Q9R0G7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Zeb2Q9R0G7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Zeb2Q9R0G7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC31,04■■■□□ 2,56
Zeb2Q9R0G7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms