Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prkab1Q9R078 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prkab1Q9R078 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prkab1Q9R078 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Prkab1Q9R078 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkab1Q9R078 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkab1Q9R078 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkab1Q9R078 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkab1Q9R078 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkab1Q9R078 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prkab1Q9R078 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prkab1Q9R078 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prkab1Q9R078 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prkab1Q9R078 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prkab1Q9R078 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prkab1Q9R078 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prkab1Q9R078 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prkab1Q9R078 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkab1Q9R078 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prkab1Q9R078 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prkab1Q9R078 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkab1Q9R078 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkab1Q9R078 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkab1Q9R078 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkab1Q9R078 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prkab1Q9R078 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prkab1Q9R078 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prkab1Q9R078 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prkab1Q9R078 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prkab1Q9R078 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prkab1Q9R078 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Prkab1Q9R078 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prkab1Q9R078 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkab1Q9R078 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkab1Q9R078 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkab1Q9R078 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prkab1Q9R078 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prkab1Q9R078 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prkab1Q9R078 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prkab1Q9R078 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prkab1Q9R078 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prkab1Q9R078 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prkab1Q9R078 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prkab1Q9R078 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Prkab1Q9R078 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prkab1Q9R078 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prkab1Q9R078 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prkab1Q9R078 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Prkab1Q9R078 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prkab1Q9R078 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prkab1Q9R078 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prkab1Q9R078 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prkab1Q9R078 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prkab1Q9R078 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkab1Q9R078 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms