Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb1bp2Q9R000 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb1bp2Q9R000 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb1bp2Q9R000 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb1bp2Q9R000 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb1bp2Q9R000 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms