Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR5

Hipk2, Homeodomain-interacting protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk2Q9QZR5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hipk2Q9QZR5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hipk2Q9QZR5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hipk2Q9QZR5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hipk2Q9QZR5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hipk2Q9QZR5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hipk2Q9QZR5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hipk2Q9QZR5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hipk2Q9QZR5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hipk2Q9QZR5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hipk2Q9QZR5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hipk2Q9QZR5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hipk2Q9QZR5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hipk2Q9QZR5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hipk2Q9QZR5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hipk2Q9QZR5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hipk2Q9QZR5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hipk2Q9QZR5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hipk2Q9QZR5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hipk2Q9QZR5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms