Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc4Q9QZD4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc4Q9QZD4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc4Q9QZD4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc4Q9QZD4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc4Q9QZD4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc4Q9QZD4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc4Q9QZD4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc4Q9QZD4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc4Q9QZD4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc4Q9QZD4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc4Q9QZD4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc4Q9QZD4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc4Q9QZD4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc4Q9QZD4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc4Q9QZD4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc4Q9QZD4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc4Q9QZD4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc4Q9QZD4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc4Q9QZD4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc4Q9QZD4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc4Q9QZD4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc4Q9QZD4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc4Q9QZD4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ercc4Q9QZD4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ercc4Q9QZD4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ercc4Q9QZD4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ercc4Q9QZD4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ercc4Q9QZD4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ercc4Q9QZD4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ercc4Q9QZD4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc4Q9QZD4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc4Q9QZD4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc4Q9QZD4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc4Q9QZD4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ercc4Q9QZD4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ercc4Q9QZD4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ercc4Q9QZD4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ercc4Q9QZD4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms