Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYI3

Dnajc7, DnaJ homolog subfamily C member 7, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc7Q9QYI3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnajc7Q9QYI3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnajc7Q9QYI3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnajc7Q9QYI3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnajc7Q9QYI3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnajc7Q9QYI3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnajc7Q9QYI3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnajc7Q9QYI3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnajc7Q9QYI3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dnajc7Q9QYI3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dnajc7Q9QYI3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnajc7Q9QYI3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnajc7Q9QYI3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnajc7Q9QYI3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnajc7Q9QYI3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnajc7Q9QYI3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnajc7Q9QYI3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnajc7Q9QYI3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnajc7Q9QYI3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnajc7Q9QYI3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnajc7Q9QYI3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnajc7Q9QYI3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnajc7Q9QYI3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnajc7Q9QYI3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnajc7Q9QYI3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnajc7Q9QYI3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnajc7Q9QYI3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnajc7Q9QYI3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnajc7Q9QYI3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnajc7Q9QYI3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnajc7Q9QYI3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnajc7Q9QYI3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnajc7Q9QYI3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnajc7Q9QYI3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnajc7Q9QYI3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnajc7Q9QYI3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnajc7Q9QYI3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms