Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdh11Q9QYF1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdh11Q9QYF1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdh11Q9QYF1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rdh11Q9QYF1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh11Q9QYF1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh11Q9QYF1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh11Q9QYF1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh11Q9QYF1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh11Q9QYF1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdh11Q9QYF1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdh11Q9QYF1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdh11Q9QYF1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdh11Q9QYF1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdh11Q9QYF1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdh11Q9QYF1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdh11Q9QYF1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdh11Q9QYF1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdh11Q9QYF1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdh11Q9QYF1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh11Q9QYF1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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