Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Plxnb3Q9QY40 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Plxnb3Q9QY40 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Plxnb3Q9QY40 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Plxnb3Q9QY40 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Plxnb3Q9QY40 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Plxnb3Q9QY40 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Plxnb3Q9QY40 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Plxnb3Q9QY40 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Plxnb3Q9QY40 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Plxnb3Q9QY40 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Plxnb3Q9QY40 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Plxnb3Q9QY40 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Plxnb3Q9QY40 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Plxnb3Q9QY40 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Plxnb3Q9QY40 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Plxnb3Q9QY40 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Plxnb3Q9QY40 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Plxnb3Q9QY40 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Plxnb3Q9QY40 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Plxnb3Q9QY40 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Plxnb3Q9QY40 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Plxnb3Q9QY40 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plxnb3Q9QY40 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Plxnb3Q9QY40 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Plxnb3Q9QY40 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Plxnb3Q9QY40 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Plxnb3Q9QY40 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Plxnb3Q9QY40 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plxnb3Q9QY40 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Plxnb3Q9QY40 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Plxnb3Q9QY40 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plxnb3Q9QY40 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Plxnb3Q9QY40 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Plxnb3Q9QY40 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Plxnb3Q9QY40 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Plxnb3Q9QY40 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Plxnb3Q9QY40 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Plxnb3Q9QY40 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Plxnb3Q9QY40 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Plxnb3Q9QY40 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Plxnb3Q9QY40 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Plxnb3Q9QY40 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Plxnb3Q9QY40 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Plxnb3Q9QY40 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plxnb3Q9QY40 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plxnb3Q9QY40 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plxnb3Q9QY40 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Plxnb3Q9QY40 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Plxnb3Q9QY40 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plxnb3Q9QY40 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Plxnb3Q9QY40 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Plxnb3Q9QY40 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Plxnb3Q9QY40 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms