Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tspan3Q9QY33 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tspan3Q9QY33 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tspan3Q9QY33 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tspan3Q9QY33 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tspan3Q9QY33 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tspan3Q9QY33 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tspan3Q9QY33 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tspan3Q9QY33 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tspan3Q9QY33 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tspan3Q9QY33 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tspan3Q9QY33 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tspan3Q9QY33 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tspan3Q9QY33 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tspan3Q9QY33 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tspan3Q9QY33 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tspan3Q9QY33 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tspan3Q9QY33 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tspan3Q9QY33 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tspan3Q9QY33 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tspan3Q9QY33 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan3Q9QY33 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan3Q9QY33 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tspan3Q9QY33 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tspan3Q9QY33 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tspan3Q9QY33 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tspan3Q9QY33 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tspan3Q9QY33 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tspan3Q9QY33 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan3Q9QY33 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan3Q9QY33 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tspan3Q9QY33 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tspan3Q9QY33 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tspan3Q9QY33 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tspan3Q9QY33 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tspan3Q9QY33 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan3Q9QY33 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan3Q9QY33 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tspan3Q9QY33 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tspan3Q9QY33 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tspan3Q9QY33 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tspan3Q9QY33 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tspan3Q9QY33 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tspan3Q9QY33 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tspan3Q9QY33 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tspan3Q9QY33 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tspan3Q9QY33 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tspan3Q9QY33 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tspan3Q9QY33 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tspan3Q9QY33 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tspan3Q9QY33 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tspan3Q9QY33 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tspan3Q9QY33 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan3Q9QY33 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tspan3Q9QY33 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tspan3Q9QY33 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tspan3Q9QY33 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tspan3Q9QY33 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tspan3Q9QY33 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tspan3Q9QY33 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tspan3Q9QY33 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tspan3Q9QY33 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tspan3Q9QY33 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tspan3Q9QY33 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tspan3Q9QY33 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tspan3Q9QY33 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tspan3Q9QY33 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan3Q9QY33 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan3Q9QY33 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tspan3Q9QY33 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tspan3Q9QY33 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tspan3Q9QY33 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tspan3Q9QY33 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tspan3Q9QY33 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tspan3Q9QY33 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tspan3Q9QY33 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tspan3Q9QY33 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.5 ms