Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkp3Q9QY23 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkp3Q9QY23 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkp3Q9QY23 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkp3Q9QY23 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkp3Q9QY23 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkp3Q9QY23 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkp3Q9QY23 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp3Q9QY23 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp3Q9QY23 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp3Q9QY23 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp3Q9QY23 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkp3Q9QY23 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkp3Q9QY23 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkp3Q9QY23 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkp3Q9QY23 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkp3Q9QY23 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkp3Q9QY23 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkp3Q9QY23 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkp3Q9QY23 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp3Q9QY23 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp3Q9QY23 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkp3Q9QY23 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkp3Q9QY23 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkp3Q9QY23 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkp3Q9QY23 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkp3Q9QY23 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp3Q9QY23 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp3Q9QY23 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp3Q9QY23 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp3Q9QY23 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkp3Q9QY23 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkp3Q9QY23 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp3Q9QY23 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp3Q9QY23 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp3Q9QY23 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp3Q9QY23 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp3Q9QY23 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp3Q9QY23 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp3Q9QY23 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkp3Q9QY23 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp3Q9QY23 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkp3Q9QY23 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkp3Q9QY23 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp3Q9QY23 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkp3Q9QY23 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkp3Q9QY23 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkp3Q9QY23 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp3Q9QY23 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp3Q9QY23 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.3 ms