Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hacl1Q9QXE0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hacl1Q9QXE0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hacl1Q9QXE0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hacl1Q9QXE0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hacl1Q9QXE0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hacl1Q9QXE0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hacl1Q9QXE0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hacl1Q9QXE0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hacl1Q9QXE0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hacl1Q9QXE0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hacl1Q9QXE0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hacl1Q9QXE0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hacl1Q9QXE0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hacl1Q9QXE0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hacl1Q9QXE0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hacl1Q9QXE0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hacl1Q9QXE0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hacl1Q9QXE0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hacl1Q9QXE0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hacl1Q9QXE0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hacl1Q9QXE0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hacl1Q9QXE0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms