Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trpc5Q9QX29 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trpc5Q9QX29 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trpc5Q9QX29 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trpc5Q9QX29 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trpc5Q9QX29 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trpc5Q9QX29 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Trpc5Q9QX29 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trpc5Q9QX29 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Trpc5Q9QX29 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trpc5Q9QX29 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trpc5Q9QX29 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Trpc5Q9QX29 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Trpc5Q9QX29 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpc5Q9QX29 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpc5Q9QX29 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpc5Q9QX29 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpc5Q9QX29 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trpc5Q9QX29 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trpc5Q9QX29 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trpc5Q9QX29 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trpc5Q9QX29 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trpc5Q9QX29 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpc5Q9QX29 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpc5Q9QX29 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Trpc5Q9QX29 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Trpc5Q9QX29 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trpc5Q9QX29 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trpc5Q9QX29 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trpc5Q9QX29 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trpc5Q9QX29 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trpc5Q9QX29 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Trpc5Q9QX29 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trpc5Q9QX29 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trpc5Q9QX29 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Trpc5Q9QX29 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trpc5Q9QX29 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trpc5Q9QX29 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trpc5Q9QX29 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trpc5Q9QX29 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trpc5Q9QX29 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpc5Q9QX29 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpc5Q9QX29 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpc5Q9QX29 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpc5Q9QX29 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trpc5Q9QX29 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpc5Q9QX29 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpc5Q9QX29 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpc5Q9QX29 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpc5Q9QX29 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trpc5Q9QX29 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trpc5Q9QX29 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpc5Q9QX29 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpc5Q9QX29 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpc5Q9QX29 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trpc5Q9QX29 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trpc5Q9QX29 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trpc5Q9QX29 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trpc5Q9QX29 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trpc5Q9QX29 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trpc5Q9QX29 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Trpc5Q9QX29 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trpc5Q9QX29 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpc5Q9QX29 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpc5Q9QX29 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpc5Q9QX29 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trpc5Q9QX29 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trpc5Q9QX29 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trpc5Q9QX29 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trpc5Q9QX29 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trpc5Q9QX29 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trpc5Q9QX29 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Trpc5Q9QX29 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trpc5Q9QX29 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trpc5Q9QX29 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trpc5Q9QX29 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Trpc5Q9QX29 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trpc5Q9QX29 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trpc5Q9QX29 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trpc5Q9QX29 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Trpc5Q9QX29 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Trpc5Q9QX29 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trpc5Q9QX29 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trpc5Q9QX29 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trpc5Q9QX29 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms