Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dkk3Q9QUN9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Dkk3Q9QUN9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Dkk3Q9QUN9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dkk3Q9QUN9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dkk3Q9QUN9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dkk3Q9QUN9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms