Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pole3Q9JKP7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pole3Q9JKP7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pole3Q9JKP7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pole3Q9JKP7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pole3Q9JKP7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pole3Q9JKP7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pole3Q9JKP7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pole3Q9JKP7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pole3Q9JKP7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pole3Q9JKP7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pole3Q9JKP7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms