Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trem3Q9JKE1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trem3Q9JKE1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trem3Q9JKE1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trem3Q9JKE1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trem3Q9JKE1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trem3Q9JKE1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trem3Q9JKE1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trem3Q9JKE1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trem3Q9JKE1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trem3Q9JKE1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trem3Q9JKE1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trem3Q9JKE1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trem3Q9JKE1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trem3Q9JKE1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trem3Q9JKE1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms